Incluindo o chosen em algumas de minhas páginas (sistemas) notei que um probleminha estava acontecendo. Toda vez que eu tentava preencher com alguns caracteres para ele filtrar os termos e facilitar minha escolha eu recebia a mensagem de que o termo não foi encontrado, porém, quando o termo possuia mais de uma palavra e eu preenchia os caracteres relativos a esta segunda palavra, a busca funcionava.
A solução para isso é bem simples, basta retirar a identação deste ponto da página, por exemplo, quando colocado conforme abaixo:
<option>
Valor a escolher
</option>
Se você preencher o termo de busca com "esco" ele vai encontrar o termo, porém, se colocar "valo" o termo não será encontrado.
Agora, sem a identação:
<option>Valor a escolher</option>
A busca funciona normalmente.